p.o. Dyrektora mgr Elżbieta Mickiewicz-Dytko, która:
- Zarządza, kieruje i reprezentuje Międzyleski Szpital Specjalistyczny w Warszawie na zewnątrz,
- samodzielnie podejmuje decyzje dotyczące Szpitala (chyba, że obowiązujące przepisy stanowią inaczej) i ponosi za nie odpowiedzialność.
Dyrektor kieruje Szpitalem przy pomocy:
- Zastępcy dyrektora ds. lecznictwa – funkcję sprawuje dr n. med. Witold Pikto-Pietkiewicz, który kieruje i nadzoruje pracę pionu medycznego w zakładach leczniczych „Lecznictwo stacjonarne” i „Lecznictwo ambulatoryjne”.
- Zastępcy dyrektora ds. administracyjno-technicznych - funkcję sprawuje mgr inż. Krzysztof Czebreszuk, który kieruje i nadzoruje pracę pionu administracyjno – eksploatacyjnego.
- Zastępcy dyrektora ds. finansowo-ekonomicznych
- Zastępcy dyrektora ds. pielęgniarstwa - funkcję sprawuje mgr Sylwia Bartnicka, która kieruje i nadzoruje pracę w pionie medycznym w zakładach leczniczych: „Lecznictwo stacjonarne” i „Lecznictwo ambulatoryjne”. Odpowiada za zagwarantowanie kompleksowej opieki pielęgniarskiej w MSSW, organizuje i nadzoruje pracę personelu pielęgniarskiego, położnych, ratowników medycznych i pomocniczego personelu medycznego oraz higieny szpitalnej, centralnej sterylizacji, poradni profilaktyki i promocji zdrowia a także pracownika socjalnego.
W Międzyleskim Szpitalu Specjalistycznym w Warszawie działa Rada Społeczna która jest organem inicjującym i opiniodawczym Samorządu Województwa Mazowieckiego oraz organem doradczym Dyrektora.